鄭成功治臺很短，無法看出什麼成果。倒是「屯兵」制不久後顯出效果。蓋自鄭成功東征來臺，留守金廈諸將皆抗命，不發一船來援致使糧絕。
鄭成功為此奔波，甚至達「官兵至食木子充飢，日憂脫巾（脫袍投降）之變。」的境地。除派人於鹿耳門等候糧船外，若有官私船東來者盡行買糴（糧）給官兵。並於4社秋收時持金10錠去買禾粟，但也只可給食10日。
而「屯兵」初時，疾疫大作，加上水土不合，死者更多。《臺灣外記》也記：
「時臺地初闢，水土不服，病者即死。故自各島搬眷，俱遷延不前。」
臺灣初闢的困難，在缺糧下又要招撫番社，又要包圍熱蘭遮城，其困難可想而知。而臺灣的危險，也使金廈各島將士，不肯搬眷來臺。即使為了爭奪權力，一度來臺的鄭經，等權力到手，也以剿除鄭泰為名，回駐廈門。
直到永曆18年（1664），金廈為清所陷，加上降將黃梧獻平海5策，沿海既遷界，無法掠取糧餉。鄭經只好率眾來臺，而當時臺灣的開墾，已有成效，足可提供來臺將士之用。
來臺後的鄭經，為加緊儲糧，因此，採用諮議參軍陳永華的建議，開始經略臺灣。陳永華，字复甫，福建同安人。永曆初，投靠鄭成功，因有幹才，為鄭成功賞識，授參軍職。
永曆15年（1661）晉升為諮議參軍，協助鄭成功攻臺。鄭成功死後，輔佐鄭經開始經營臺灣。
明永曆18年（1664），來臺後的鄭經，在陳永華輔佐下，除繼續實施寓兵於農的「屯兵」政策外。重新規劃行政區域，改東都為東寧（台南市）。
並改東興及萬年兩縣，為東興（台南縣北）及萬年（台南縣南）兩州，分諸將土地。課耕種、徵租賦、稅丁庸。並於南北兩路分設安撫司，鼓勵各鎮墾殖。
澎湖因地位重要，除設安撫司外，另置部隊防守。對於東寧府的建設，也能在荷蘭人既有的建設上，添加建設。使其更壯觀宏偉，他在柴頭港（臺南市大甲里）建窰，教人製磚瓦。並派人往內山伐木取材，以建造街道房屋，及衙門房舍。
並以荷蘭人留下的十字街，為經緯，劃分四坊，名東安、西定、寧南和鎮北。各坊置有簽長（區長）。4坊總計24里，實施明代保甲制，里設里正。其里，再編以10戶為牌，設牌首。10牌為甲，設甲首。10甲為保，設保長。
上下層次分明，管理容易。而對於原有平埔族散居其內的東寧府，以及平埔族人數較多的新善、開恩等里，則仍為社，社設鄉長，由社中頭目擔任，以理番務。
陳永華經略臺灣
明永曆19年（1665）開始以明朝體制蓋孔廟，建學校。起初，鄭經以臺灣地狹人疏為由擬暫緩，但陳永華勸之：
「成湯以百里而王，文王以七十里而興，豈關地方廣闊？實在國君好賢，能求人材以相耳。今臺灣沃野千里，遠濱海外，且其俗醇，使國君能舉賢以助理，則十年生長、十年教養，十年成聚，三十年可與中原相甲乙，何愁其狹促稀少哉？
今既足食，則當教之，使逸居無教，何異禽獸？須擇地建立聖廟，設學校，以收人才，遮國有賢士，邦本自固，而世運日昌。」
鄭經納其言，永曆20年（1666）終在承天府內，建造全臺第1座孔廟。其旁置有明倫堂。陳永華對學校設置，亦沿明朝科舉制度，設有學院、府學、州學、社學等四種。
「三年兩試，照科歲例開試儒童，州試有名送府，府試有名送院，院試取中，准充入大學，仍按月月課，三年取中試者，補六官都事，摺用升轉。」
至於偏遠的社學，則沿襲荷蘭時期由識字的平埔族教學，稱「教冊番」，享有歲納1石之優待。明鄭時期對臺灣教育貢獻十分有限，僅限東寧府附近，不似荷蘭和西班牙，教化至非常偏遠地區，且有不畏死傳教士為前導，在各處設立學校。
但因陳永華主張在東寧府，設置象徵中國封建儒教的孔廟，因而成為臺灣教化典範為後人歌頌。
臺灣在陳永華帶領下，除獎勵開墾，振興糖業等寓兵於農政策，也從事外貿，爭取外匯。然而這些事業所得，不足應付抗清的龐大軍需。
尤其永曆28年（1674）鄭經趁三藩之亂西征。以陳永華為勇衛兼留守東寧總制使，治理臺灣一切事宜。
三藩亂初始，臺灣尚能供給糧餉，但到該年底，因招募兵員過多且鄭經在廈門設六官，在財源不足下開始對攻佔各府、州、縣徵錢糧，也徵丁口稅稱為「毛丁」。
規定百姓年16歲以上，60歲以下者，每人每月納銀5分。
此外又徵船、鹽等稅以給兵食，但不長久，因鄭經一再背信耿精忠，促使耿精忠降清反攻鄭經，戰況急轉直下對鄭經十分不利，而臺灣蕞爾小島如何能長期供應，終因糧餉不繼致使兵潰。
鄭經不得不於永曆34年（1680）撤退回臺。而臺灣也因重稅，加上天災連連，米價騰貴，民不聊生，人心思變，種下明鄭敗亡的主因。
李政隆小檔案
李政隆原本是一位名建築師，曾任大學建築系教授，也曾榮獲教育部團體頒
發「木鐸獎」，且是深愛台灣的歷史學家，著有《新臺灣史》、《臺灣基督教史》。現任
基督教恩友中心執牧。
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