91年（2002）8月中國中共七位政委在北戴河召開十六大人事會議，對於第四代接班問題提出解決。
會中朱鎔基說：「我們年紀都大了，鄧小平說過中央領導不要超過兩屆，讓年青同志去做，給他們鍛鍊機會，可能比我們幹得好。」李瑞環也說：「個個都講要高舉鄧小平旗幟，按鄧小平指示辦事，為什麼到關鍵時候，又不按照鄧小平指示辦？我同意朱鎔基的意見。」（三四九 1）
最後在朱鎔基、李瑞環、尉健行和胡錦濤等人堅持下，四比三票，決定了江澤民不再連任，奠下 11月 15日第十六屆一中全會，江澤民、李鵬、朱鎔基、李瑞環、李嵐清、慰健行等七位政委全部卸任，改由九位新政委全面接替的局面。（三四九 2頁）
中國開始走入每任二屆的集體統治體制。號稱中國第四代領導人的新任政委，以胡錦濤為核心，還有 1935年至 1944年間出生的溫家寶、曾慶紅、李長春、吳官正、羅幹、吳議、黃菊等人。
事實上胡錦濤統治中國，並非意料中順利。中國問題，不僅是經濟快速成長下，帶來的社會貧富懸殊與失序問題，此外，還有伴隨經濟改革而來的民主化及自由化需要。
2001年時，中國加入世界貿易組織時，對外經貿的承諾，以及中國與東協簽署自由貿易區，也會讓大批東協的農產品進入中國，在在都會影響中國已十分嚴重的失業和農民問題。另外，中國東西部開發不同調，若不快速加緊西部開發及建設，也會造成國內嚴重的對立等問題，可謂百廢待舉。
對於國外部份，若不言及臺灣，表面上中國與俄美日外交雖能維持友好，但中美關係仍有很多變數，特別是美國，非常顧忌中國的崛起，因中國地大物博，人口多， 若強盛起來，不但會搶奪東南亞的支配權，也會成為美國未來的對手。故為防止中國的興起，美國不但協助日本逐步恢復軍事武力。同時，也與澳洲和印度聯合，企 圖把中國繼續封鎖在中國的範圍內。
中國崛起引起許多人擔憂，尤其關心台海局勢的人。2003年 1月美國軍情局伍卓（T. Woodrow）卻在「中國短評」的網站中說：「中共軍購從 1996年起，明顯偏重以攻擊航艦為主，包括從俄羅斯引進二艘素有『航艦殺手』的現代級驅逐艦，裝配超音速『日靈』（SS-N-22）反艦導彈，最近俄方 又同意售予北京性能較為優異的 SS-N-26 超音速反艦導彈。
在擁有四艘『基洛』級潛艦，又續購二艘現代級艦的同時，中共還計劃向俄羅斯採購八艘『基洛』級潛艦。」伍卓又稱：「美國國防部發現中共近來不斷強化潛艦的續航力和偵察能力，再配合太空和超視距的探測，有效的提升中共海軍戰力。」
而對中國海軍的崛起，伍卓在 文章中指出，臺灣海軍最近曾進行一項以 2005年的實力為模擬的演習，結果發現從美國購入的「紀德」艦全軍覆沒。所以他在臺灣海軍檢討時，就不客氣的說：「中共若動用 SS-N-26照樣會重創美國海軍」。
但此說法後來卻遭美國資深海軍官員駁回，他們自信不管中共海軍設備如何，只要美國航艦編隊一出現，中共仍會夾著尾巴 拚命逃竄。（三四九 9）
2006年是日本安全受威脅的一年。明治時期日本所以出現「征韓論」，那是中國軟弱不足以侵略日本，但強盛的俄國若佔有韓國，從地理形態對日本危害很大。
當時日本雖是小國卻仍有先行佔領朝鮮 的企圖心，可見朝鮮對日本的重要。時至今日，朝鮮已改名南北韓國，雖然北韓實施共產制度，對日本有威脅，但北韓也因面臨經濟困難，加上美國控制的南韓梗在 其中，對日本的威脅不似想像的大。
倒是過去與菲律賓呂宋、日本先島群島、沖繩群島和日本四島，形成島鏈的臺灣，不僅保障日本和南韓在東南亞自由進出的貿易航線，對日本石油資源的運輸也無後 顧之憂。
設若失掉臺灣不但東南亞航線聽命於人，對於日本的能源運輸，其花費將無可想像。何況誰佔有臺灣，不但圍堵中國的島鏈盡失，甚且繞過臺灣就可輕易直 達日本後門的橫濱和東京等地。這地方就是1854年被美國海軍叩入，才打開一連串「明治維新」的所在。
日本周邊的危機，比較難解決的反倒是臺灣。特別是中國崛起後，面對中國每年暗地高達數千億美元的國防預算，並已有能力以飛彈射下衛星後，對臺灣問 題，已非過去傳統的思維模式。臺灣人能否守住臺灣的問題，成為美日間，臺灣是否重要到不惜一切犧牲，都要保護的問題。
對此問題，負有全球戰略思維的美國， 因有北韓、伊拉克以及伊朗等問題，須借重中國折衝協助故不表態。僅能以臺灣不能通過軍購案，大肆責備臺灣，並揚言必要時將責任卸給臺灣。
但臺灣問題，尤其曾統治臺灣五十年的日本，看法就不同。因為設若中國佔有臺灣，除非美國願意付出更大犧牲，不惜一戰，否則以美國的民主特性，是不可能開戰 的。第二次世界大戰，在日本節節進逼下，美國遲遲未敢對日宣戰，就是一例。若不是日本偷擊珍珠港，才不得已宣戰。
故臺灣問題也是一樣，若美國不敢開戰，誓 必走入對日本非常不利的持久戰，如此一來，必會損害日本和南韓的能源運輸，以及在東南亞的貿易利益，甚至造成長期重大損失。何況日本後門洞開，付出的價格更高。除非日本投降，否則是經不起持久戰的。
中國一昧對外擴武，並非說中國內部就沒有問題，雖然胡錦濤在鄧小平指示下，在 2003年 3月以和平方式，從江澤民手中接下國家主席，2004年 9月 19日中共十六屆四中全會最後一天，從江澤民手上接下中央軍委主席，整個接棒看來毫無瑕疵。
事實鄧小平設計的接班計劃，二屆一任，每兩屆更換一批新人領導，看似合理，也避免接班時的無情鬥爭。但人總是人，接班制度開始實施，或許舊勢力有限， 2002年北戴河十六大人事會議，對於胡錦濤接班也是四比三，在江澤民反對下勉強達成接班協議。因此使中國的統治，有了新舊勢力的爭執問題。
這個問題起初不嚴重，直到 2004年 7月中共召開政治局會議，原屬江澤民代表「上海幫」的上海市委書記陳良宇，因胡錦濤、溫家寶二人曾親赴上海視察，為緩和中國過熱經濟，主張採取宏觀調控。 並對帶動經濟發展的鋼鐵、和房地產業加以管制，使得浙江和江蘇等東部各省，造成嚴重傷害。為此，當著胡錦濤面前，要求總理溫家寶負起政治責任下台。
就在中國以指定的方式中接班，臺灣也正上演一場以選舉為勝負的接班。原來二千年總統大選時，曾被形容為「James 颱風」的宋楚瑜，以其幹練的行政能力，清廉的外表，塑造勤政愛民的形像，成為眾所矚目，理應順利當選總統的人。
不料卻在選前爆發了「興票案」，陰溝裏翻船，使得原本對他盼望的人大失所望。不但宋楚瑜未能當選，甚至與連戰爭鬥結果，「鷸蚌相爭，漁翁得利」，使原本不被看好的陳水扁因而當選。
而連戰和宋楚瑜也因在選戰中互揭瘡疤結果，造成很深的仇恨。國民黨以無記名的「贊助」廣告，「禮義廉恥，請問宋楚瑜」，一再以「興票案」責問宋楚瑜。
而宋楚瑜則以超黨派立委名義，刊登「禮義廉恥，請問連戰」，一再質疑連戰提出「你是平民嗎？」、「你清廉嗎？」、「你誠實嗎？」、還有以「你胸懷開闊嗎？」回敬。
雖說連宋二人二千年大選中互揭瘡疤，但國民黨歷經兩蔣數十年貪腐結構經營，決非選舉中三言兩語就可蓋棺論定。但洗刷過去相罵污名總是必要。對於宋楚 瑜涉及的「興票案」，台聯召開記者會說：「李登輝握有更多內幕，宋出來選，就要讓宋落選。」
而宋則舉李登輝所出新書《李登輝執政告白實錄》說：「書中提 到，興票案是國民黨為了兩千年總統選舉設計的選舉策略，顯然『興票案』是專門為打擊宋楚瑜量身定做的選舉伎倆，若真有『更多內幕』，李登輝早在上次總統大 選就全都出手，哪會留一手，等2004年大選再用？台聯立委應下點功夫了解他們精神領袖講過的話。」
而欲借拉法葉弊案「漂白」自己的宋楚瑜，話峰一轉開始責備民進黨：「民進黨政府現在只會對拉法葉軍購弊案的枝微末節，作無謂的影射，卻不顧真正清查案情， 影響國家形象甚鉅，所以他才會在前幾天批評民黨政府包庇、無能。」
他再度提醒民進黨說：「民進黨政府完全不了解國民黨政府時代的組織架構，『秘書處』的駐 管是秘書處主任，而『秘書長』則是黨主席的幕僚長，國民黨的負責人是黨主席，作為國家元首和三軍統帥，李登輝應對當時軍購相關流程最清楚。」
陳水扁政績持平而論並不好，不好的原因，因政黨輪替許多政策不熟悉，而且陳水扁個性剛愎自用，不聽人言。像農漁會合作社，不聽李登輝建言，可以收編使成為民進黨建設農漁村工具。但因疑心作崇，以為是李登輝保留的樁腳，欲加以消滅，將農漁會合作社說是黑金溫床。結果適得其反，最後以道歉收拾殘局。
此外，立法院朝小野大，不識時務，在無評估成敗下，一意停建核四廠，結果核四停工了，但在立院表決下失敗又復工了，不僅造成工程損失，還賠償了很多金錢。《天下》雜誌社主編高希均說：「錯誤的政策，比貪污更可怕。」陳水扁造成的國家損失，光是核四賠償就不可計數。
像這樣欠缺施政經驗如同嬰兒學走路，所處的環境盡是「藍營」，本該沉潛伺機而動。但不甘坐困愁城，個性又倔強的陳水扁偏要有所作為，在 90年（2001）假全國經濟發展會議發表對中國「積極開放、有效管理」，使得維繫勞工就業的「傳統工業」大量走光。
臺灣賴以生存的中小企業開始消失。有一個很重要統計， 91年（2002）5月一般銀行對中小企業放款，較去年同期減少四千七百九十二億，減幅達十四點四%，財經界以「情況至為危急」形容。
臺灣新設銀行都有一個特色，與其說是正派經營，不如說是財團募資機器。所以逾放比高，並非民間正當貸款留下的債務。而陳水扁政府卻無視此現象的存在，謀求改革，卻一視同仁，逕自提出『二五八』金融改革政策。
93年（2004）5月25日他在「臺灣金融服務業聯合總會成立大會」致詞，還自豪的說：
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「本人特別將民國 90年定為『金融改革元年』，並於當年通過了『金融六法』為後續金融改革奠定了初步的基礎，接著於 91年 8月提出『二五八』金融改革的目標：要在二年內將逾放比降到五%以下，將資本適足率提高至八%以上。
為什麼實施「二五八」金改，因 90年（2001）第三季逾放比高達 7.79%，若加入「觀察」逾放比則達 11點 53%，創下歷史新高。廣義的說，這些逾放金額已高達一點六三兆，政府意識到逾放快速增加確實威脅金融體系，故有「二五八」金改政策。
為了配合政府政策，三商銀等官股銀行首當其衝，無不積極降低逾期放款。最快的方法，乃是以 2折至 3折的低價，出售不良債權（NPL）給金融資產管理公司（AMC），卻給了存心倒帳的企業一個機會。《自由電子報》登載，三商銀表示，AMC收購了NPL 的後續處理，銀行無權管轄。
不少債務人利用此漏洞，成立新公司或借他人名義，以最多只付 50、 60%，就取回遭銀行拍賣的擔保品相當划算。對於這種快速出賣債權給AMC，三商銀主管表示，即使銀行已仔細評估NPL標售底價，但礙於時間也不敢喊高價 格，無擔保的債權只能賣 2折多一點，有擔保的最多也是 3、 4折，因此屢遭外界抨擊賤賣家產。
然而銀行也學到經驗，紛紛自行成立AMC，債權從右手到左手，等於自己買債存放在自己銀行裏，就可表面降低逾放比，符合 政策需要。
為什麼民進黨要推動公投法呢？是為了總統大選。
因為陳水扁的政績實在不好，必須在 2004年總統大選時，另外尋找一個可替代，讓臺灣人感同身受的題材，轉移對陳水扁施政要求。而全民公投剛好具有「朝小野大」，政策無法施展，將施政成敗全推給在野黨，「軟弱的總統」將重要決策，只能訴之於全民，博取同情的優點。
何況「全民公投」這在其他民主國家是尋常的事，何以到了臺灣就不可行，凸顯臺灣並沒有真正民主。還有表面上說臺灣是主權獨立國家，但到真正決定臺灣自己前途時，卻又處處不能，也凸顯臺灣在法理上還沒有獨立。90年（2001）1月民進黨為了廢核四，立法院在朝小野大表決失敗後，很多人就主張「公投」。
主戰派利用公投法逼迫民進黨在統獨明確表態，並且為公投法設下種種限制，公投似成為泛藍的政治工具。國親版的「公投法」，92年（2003） 11月 27日三讀通過，通過的第二天，連戰就宣佈國親將提五大公投議題，像族群和解公投、債留子孫公投、教改公投、健保雙漲公投、高雄自由貿易港公投等五大民生公投。可惜法雖通過，但舉行公投的內容和時間，卻是在野黨連戰等無法掌控的。
倒是有了公投法的立法依據， 92年（2003）7月行政院就有權以行政手 段，正式公佈「全國公民投票實施要點」，明定公投議題可由相關部門擬定，報呈行政院「公民投票委員會」審核，並經行政院院會通過後實施。與此同時，陳水扁 也透過公開談話，宣示明年總統大選前，務會辦理「公民投票」。
他說：「公民投票，是當代民主國家處理重大政策爭議，與民生議題時的正常方式，也是國民主權 的體現。因此為落實直接民權，保障人民參與公共政策制定的基本權利，我鄭重宣示，政府將在 93年 3月 20日總統大選日，針對國內重大公共議題舉行公民投票，由人民直接做成最後的決定，積極消弭各界的歧見與紛爭。」
總統大選，就在「大選綁公投」中如火如荼開打時。不料 86年（1997）東帝士五十週年慶，意氣風發接受連戰等名流慶賀，前東帝士總裁陳由豪，原本資產達二千多億的企業家，因過度投資中國導致失敗，掏空公司 623億債務逃亡中國，因債務過於龐大 92年（2003） 成為十大通緝犯之一。
原以為經商失敗的他，沒想到卻成為中國該年度營業額最高，繳稅最多的台商。並且以中國的護照，公然自由的進出美國，成為「債留臺灣， 錢進大陸」臺灣人不恥的台商。這樣的人卻在總統大選的前夕， 3月 5日在洛杉機召開記者會，宣稱 83年（1994）及 87年（1998）陳水扁二次台北市長選舉都接受他的政治獻金三百萬元。
尤其第一次更在沈富雄陪同親自送到民生官邸，由總統夫人吳淑珍收下。這件原本微不足道法律允許的政治獻金，陳由豪當時也給國民黨一億元。卻因吳淑珍情急，欲撇清與陳由豪關係而否認。她說：「若有接受陳由豪的政治獻金，我和陳水扁願意退出政壇。」使整個事件延燒，最後涉及總統「誠信」而被擴大。
加上陳由豪口中的證人，民進黨立委沈富雄又藏匿起來，總統誠信成為懷疑。這件因沈富雄「大老失蹤事件」，曾一度危及陳水扁選情，直到輿論譁然，沈富雄不得不召開記者會，以「三個可能」和「四個可能」，懸疑說辭落幕，但已造成陳水扁很大傷害。至於陳由豪與吳淑珍是否會面，則等到 95年（2006）5月底沈富雄才公開對外承認。
3月 19日總統大選前一日，陳水扁偕呂秀蓮全省掃街拜票，不料卻在台南，中午一點四十五分，為槍手伏擊二發子彈，一發打中吉普車窗，反彈傷及呂秀蓮膝蓋。另一 槍則打中陳水扁肚皮，造成長十一公分、深二公分的傷勢，緊急送到奇美醫院醫治，醫院檢查，幸未傷及腸腹，沒有生命危險。
陳水扁的當選，不被連宋承認。九十二年（2003）11月，連戰在桃園造勢，以「這個國家，仇恨到此為止」為主題。他說：「我也有一個和解的夢，強調連、宋、扁以及所有臺灣人民的子孫都是一家人。」又說：「我連戰懇求大家，所有臺灣歷史族群的仇恨到此為止吧。」（三二一 206頁）
等到 3月 19日開票選輸，竟在其競選總部鼓動抗議。起先他站在全國電視機前面，向全國觀眾說：「我們不在乎輸贏，要冷靜要理性」。當大家不禁要讚賞他的風度時。
豈知他突然話風一轉，改口說：
「此次選舉疑雲重重，為了向歷史、民主制度以及二千三百萬人民交代，這是一場不公平的選舉，我們要提出選舉無效之訴！」
對於 3月 27日集會，政府被迫嚴陣以待，許多人對於當日是否會發生類似中選會的「暴力衝突」，都持難以樂觀態度。
同時，為免民進黨支持者反制，造成不可收拾的衝突，民進黨要求支持者，避開泛藍集會路線，且做到「綠人止步」，不要穿扁衣、扁帽等刺激藍軍衣服，鼓勵支持者到郊區活動，若仍不甘，民進黨並設有專線，提供支持者發洩。
同時，由行政院長游錫堃出面，要求馬英九負起台北市長維安責任，並勸導連宋懸崖勒馬：「你們的行為將是臺灣社會、國際形象、族群和諧的重要關鍵。但你們一己的私慾，也可能賠上整個臺灣！」，並呼籲他們說：「不要讓三二七成為臺灣民主的惡夢」（四 84頁）
就在三二七的前夜中國表態後不久，被國親用來質疑陳水扁當選正當性的美國，也發現事態嚴重，若不及早表態後果可能不堪設想，於是在該夜凌晨發出賀電，「祝 賀陳水扁總統在大選中獲得勝利」。
同時在賀電中也提到，美國「已注意到選舉結果有爭議，但相信臺灣各方，都會依照法律機制解決此一爭執，反對暴力主張」的 聲明。這個賀電，對國親集會，不異潑下一盆冷水，使「美國也不承認的選舉」藉口，為之破滅。
對於連宋陣營宣稱選舉作假，要求重新驗票一事，事實上有二個途徑，一條是由立法院召集臨時會，修改「選罷法」，增列「若得票差距小於百分之一可採行政驗票」。但此修法，連宋以「緩不濟急」，無法達到四十八小時內重新驗票目的為由拒絕。
另一方面，行政院法規會主委陳美伶表示，須經法院訴訟，但其條件， 則必須連宋和中選會都承認有計票問題，並提出證據，法院才能就有證據的部份查驗。
至於連宋所稱「重新選舉」，除非當事人死亡，否則就是「選務機關」違法或作票，嚴重到足以「影響選舉結果」才可行。沒有法源依據，加上中選會也無違法，連宋對「作票說」又毫無證據，所以高院就在 3月 25日，對連宋提出「選舉無效」及「當選無效」的訴訟，予以駁回。但卻這項循法的駁回，卻被有心解讀成「未依法律獨立審判」的「政治駁回」，使法院不得不出面否認。
就在連宋陣營對驗票要求，從行政驗票、立即驗票、最後又要司法行政驗票。一變再變之際，也不顧陳水扁在 27日晚上的承諾，仍在 29日晚上，提出「當選無效」之訴。而 30日陳水扁和呂秀蓮也共同簽下「不必舉證」，就可「全面驗票」的同意書。
就在全國進入全面驗票時，為了凝聚集會的共識，槍擊案於是又浮上台面，成為抗爭的理由。對於槍擊案造成臺灣紛爭，雖有臺灣刑事局報告，在無法取得國 親信任情況下，檢查長盧榮一在 3月 26日只得另外組織，可獨立運作的「三一九專案鑑識小組」。
其中成員，包括 3月 22日連宋陣營建議，美國鑑識專家李昌鈺博士在內。李昌鈺博士，出生江蘇六歲來台，中央警官學校畢業， 54年（1965）赴美深造取得美國紐約大學生化學博士學位，因偵辦幾件大案像 JonBenet Romsey 謀殺案、O.J.辛普森殺妻案而名滿天下，有「當代福爾摩斯」美譽。
87年（1998）起擔任美國康乃迪克州警政廰長。此次總統大選，他因擔任美國連宋後援會榮譽主席成為國親的信任。
李昌鈺雖有這些背景，但其學識客觀也為社會公認，故當「三一九專案鑑識小組」出面邀請時，李昌鈺雖在百忙中立刻應允回台協助辦案。首先他委請法醫專家韋契 特（Dr.Cyrilh Wecht）、彈道專家哈格（Michael G. Haag）現場鑑識專家龐巴克（Timothy Palmbach）等，在 28日先行來台。他們三人，立刻展開調查，次日到奇美醫院，及槍擊現場作實地調查。
92年（2003）10月陳水扁繼第一次「二五八」金改，又提出也被稱為圖利財團，金融合併的「第二次金改」。許多人好奇為何陳水扁要求金融合併，原來他以為金融機構對外要有競爭力，就要合併，因為規模大才有競爭力？然而這個說法並不被專業認同。
政大金融系主任沈中華就說：
「整併要提高集中度，但臺灣如以規模大的花旗銀行或渣打銀行為標竿，卻未注意到這些銀行是以全球為市場，『越大越好、全世界都在跑』，且以英語國家為市場，但臺灣金控的市場在哪裏呢？」他 提到如果臺灣把餅做大，成為區域銀行，但「走不去」。東南亞市場又小僅能做分行，東北亞的韓國和日本，臺灣還不夠競爭力。
而中國雖有台商生意，然而卻不能 前往。因此沈中華質疑，二次金改的目的，應該要問的是，臺灣的金融機構市場在哪裏，而不是整併後，仍在臺灣本地競爭。（三五九）
暨南國際大學金融系副教授林霖也說，過去西方認為數大就是美，但現在是「專業才是美」。
陳水扁第二次金改，亦是圖利財團之舉，我們有個例子說明，由於國營銀行買賣資產，都要受到國家法令限制，所以不能夠隨便處理資產，如同一個擁有金庫 和銀庫的富翁，卻不能打開金庫過活，只能靠著微薄的存收款收入維生。
何況銀行本是公務機構，「吃大鍋飯」，不會積極經營，以致經常赤字，每年入不敷出，像 這樣的銀行，如同坐在金山上的乞丐，股票沒人買，成為沒有價值的國營企業。這樣不公平股市評價，也許國民不懂，可是主持國家大政的人，難道也不懂嗎，所以 就以乞丐的身價，把整個金山、銀山賣掉。
這個例子，我們也可以台鐵目前的高負債來說，因台鐵屬公營事業不能隨意處置資產，以致負債超過八百億元，成為經營非常困難的公司。如果台鐵有股票或對外釋 股，肯定也沒有人敢買，我們豈可因此斷定台鐵就沒有價值。目前他們稍一整理，發現光是台北機廠幾處土地，公告地價就值一千多億元，若開發利潤可達二千五百 多億元。
只要政府點頭就可還債，十年後成為人人稱羨的企業。所以對於陳水扁政府，美其名為「第二次金改」，其實是賤賣銀行資財圖利財團，其數目甚至以 「兆」元為單位計算。許多知名財團，像這次捲入彰銀的台新金，其他還有中信金、開發金、金鼎券等，為了擠進這百年難得一見的「大」圖利機會，互相排擠、鬥 爭，其醜態百出，演盡了奸商和奸官的面目。
